หลังการบรรยายในกรุงปารีส โรเบิร์ต แลงดอน ศาตราจารย์ชื่อดังด้านศาสตร์สัญลักษณ์แห่งมหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ด ถูกตามตัวกลางดึก ขณะนอนพักอยู่ในโรงแรม เมื่อฌาคส์ โซนิแยร์ ภัณฑารักษ์ผู้มีชื่อเสียงประจำพิพิธภัณฑสถานลูฟร์ถูกฆาตกรรมพิศวงในพิพิธภัณฑ์ โดยทิ้งรหัสลับปริศนาไว้ให้แลงดอนกับโซฟี เนอเวอ หลานสาวของตน เป็นผู้ไขเพื่อหาตัวฆาตกร รหัสลับทั่โซนิแยร์ทิ้งไว้อย่างชาญฉลาดกับศพของตนเองเกี่ยวพันกับ ผลงานศิลปินของ เลโอนาร์โด ดาวินชี ศิลปินเรื่องชื่อแห่งยุคเรอเนสซองซ์ และนำไปสู่รหัสลับอื่นๆ ตามมาเป็นลำดับ รวมทั้งภาพโมนาลิซา รหัสลับที่ปรากฎอยู่ต่อหน้าต่อตา แต่ไม่มีผู้ใดล่วงรู้ นอกจากผู้ที่ผ่านการเลือกสรรจากโซนิแยร์ คือแลงดอนกับเนอเวอเท่านั้น จึงสามารถถอดรหัสมหัศจรรย์นี้ออก รหัสลับที่ไม่เพียงแต่จะเผยความลับสุดยอด ซึ่งโซนิแยร์รักษายิ่งชีพเท่านั้นแต่ยังโยงใยไปถึงประวัติความเป็นมาของครอบครัวที่โซฟีไม่เคยรู้จักมาก่อนอีกด้วย พบกับ เดอะไพรเออรี่ออฟไซออน สมาคมลับที่มีอยู่จริงในประวัติศาสตร์ ซึ่งมีบุคคลชื่อดังแห่งยุค เป็นสมาชิกอย่างสืบเนื่องมาตลอดไม่ว่าจะเป็น เซอร์ไอแซก นิวตัน. เลโอนาร์โด ดาวินชี. วีกเตอร์ อูโก และพบกับความลับที่พิทักษ์สืบทอดมาช้านาน ความลับที่จะสั่นคลอยความเชื่อถือศรัทธาในคริสต์ศาสนาที่ยาวนานมากว่าสองพันปี ความลับที่ทั่วโลกจะต้องตกตะลึงพรึงเพริดเมื่อได้ทราบความลับที่จะทำให้ผู้อ่านต้องนี่งไม่ติด ด้วยความกระหายใคร่รู้ว่าสิ่งที่ผู้เขียนบรรยายมาทั้งหมดเป็นความจริงหรือไม่และเพียงใด ความลับที่ผู้อ่านจะต้องถามตนเองด้วยความพิศวงว่าเป็นไปได้หรือ